在以色列聲言要報復伊朗導彈襲擊後，伊朗民航組織發言人表示，由於營運限制，部分機場的航班一度取消。其後當局又宣布解除限制，恢復飛行。另一方面，伊朗革命衛隊精銳「聖城旅」的指揮官賈尼自上周以軍空襲黎巴嫩貝魯特後，就下落不明。
綜合路透社及法新社報道，伊朗民航組織發言人亞扎魯說，由於相關限制，「我國部分機場航班將自10月6日晚間9時起取消，直到明天10月7日上午6時」。伊朗首都德黑蘭有兩個主要機場，分別是梅赫拉巴德機場及伊瑪目霍梅尼國際機場。外界憂慮德黑蘭方面或再次向以色列發動反擊，不過當局其後取消航空管制，目前所有航班已經恢復正常。
本月1日，伊朗對以色列發射約200枚導彈，為其第2次直接攻擊對方。德黑蘭表示，相關行動是對與伊朗結盟的武裝組織領袖，以及伊朗革命衛隊一名將領遭到以色列殺害，進行報復。從那時候起，以色列就表示將會對伊朗的攻擊作出回應。
伊朗空域從10月1日晚間起關閉到3日，為期不到兩天。伊朗民航組織當時宣布，基於安全理由，國內、國際航班全面停飛。
歐盟航空安全總署已建議歐洲航空公司於31日前避開伊朗空域，並持續評估局勢。
另外，德黑蘭兩條主要隧道由6日午夜至7日清晨五時關閉。伊朗石油部長帕克．賈德前往全國最大石油設施視察，以及會晤革命衛隊的高層指揮官，討論設施安全問題。對於報道指以色列可能攻擊伊朗油田，他說不擔心敵人製造危機，指革命衛隊在保護石油設施方面作用突出。
就在局勢持續惡化之際，有伊朗官員稱，伊朗革命衛隊特種部隊「聖城旅」的指揮官賈尼失蹤。賈尼在真主黨領袖納斯魯拉上月底遭以軍空襲身亡後，前往貝魯特。官員表示，以色列上星期針對真主黨高層薩菲丁發動空襲時，賈尼正身處貝魯特南部市郊，其後伊朗和真主黨都無法聯絡賈尼。亦有消息表示，賈尼當時沒有跟薩菲丁會面。薩菲丁被視為納斯魯勒的接班人，在以軍日前空襲後傳已身亡。
對於賈尼是否已死亡，以軍發言人紹沙尼證實，上周對真主黨位於貝魯特的情報總部發動了襲擊，但對於誰人喪生尚在確認。
以色列軍方發言人哈加里近日晚稱，在伊朗大規模導彈襲擊中，位於以色列南部的內瓦提姆空軍基地和中部地區的泰勒諾夫空軍基地被伊朗導彈擊中。這是幾天來以色列軍方首次公開承認基地被伊朗導彈擊中。
